Mechanismy a role polyploidizace v evoluci živočichů – příklad ryb čeledi Botiidae

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 17 (SGA0201300005)

Hlavní účastníci

Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

13-37277S

Název projektu anglicky

Mechanisms and impact of polyploidisation in evolution of animals – lessons from the fish family Botiidae

Anotace anglicky

The present project addresses the origin and impact of polyploidisation in the freshwater fish family Botiidae, which is widespread across geologically active parts of Asia and contains two diploid and six tetraploid genera. We plan to 1) resolve the origin of polyploidy (autopolyploidisation or allopolyploidisation) using cytogenetics (whole chromosome staining, meiotic division analysis, paint probes) as well as molecular genetics (gene tree analysis of allels within tetraploid individuals), 2) test the monophyly of polyploid taxa (single or multiple polyploidisation events) by phylogenetic analyses of several nuclear and mitochondrial genes, 3) check for recent gene flow between genera of different ploidy by comparing mitochondrial and nuclear phylogenies,, 4) calculate the age of important genealogic events and compare with the geological history of the area. The data should allow drawing general conclusions on the mechanisms and impact of polyploidisation in evolution of animals.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

EG - Zoologie

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10613 - Zoology<br>10614 - Behavioral sciences biology<br>10615 - Ornithology<br>10616 - Entomology<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt řeší úlohu polyploidizace v evoluci obratlovců. Tetraploidní linie ryb čeledi Botiidae, která je pravděpodobně výsledkem allopolyploidizační události, u blízce příbuzných skupin čeledi Botiidae. Polyploidizace po hybridizaci se vyskytuje opakovaně. Polyploidizační události allopolyploidizace proběhly před 100-10 miliony let, autopolyploidizace jsou mladší.

Zahájení řešení

1. 2. 2013

Ukončení řešení

31. 12. 2016

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

5. 4. 2016

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP17-GA0-GA-U/03:1

Datum dodání záznamu

28. 6. 2017

Celkové uznané náklady

9 893 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

9 893 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč