Světlem iniciované chemické síťování a uvolnění elektronu: metody pro strukturně funkční studium proteinů
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
SGA0202000001
Hlavní účastníci
Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
20-28126S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
PHOTO-INITIATED CHEMICAL CROSS-LINKING & ELECTRON RELEASE: METHODS FOR STRUCTURE FUNCTIONAL STUDY OF PROTEINS
Anotace anglicky
The combination of Mass Spectrometry with two methodical approaches for structural- functional studies of proteins will be explored and applied in the project: (i) photo-induced crosslinking (PIXL) to study oligomerization of studied proteins in solution/membrane environment during in vitro or in vivo experiments, (ii) photo-induced electron release (PIER) – to study experiment of electron transport processes in proteins. Several structural photo-inducible analogues of canonical amino acid Met will be utilized, e.g. L-2-amino-5,5-azi-hexanoic acid and (S)-2-amino-4-azido-butanoic acid, that will be introduced into sequence of studied protein during their recombinant expression in mineral medium and auxotrophic E. coli B834 cells (employing mis-coupling activity of aminoacyl-tRNA-synthase). Two clinically significant subjects will be solved by PIXL or PIER techniques: (a) the interactions involved in CyaA-dependent invasive bacterial pathogenesis of B. pertussis, (ii) the oligomerization processes and electron transfer of azurin (metal-labeled blue copper protein from P. aeruginosa).
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10609 - Biochemical research methods
OECD FORD - vedlejší obor
—
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
CE - Biochemie<br>EB - Genetika a molekulární biologie
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2020
Ukončení řešení
30. 6. 2023
Poslední stav řešení
—
Poslední uvolnění podpory
1. 4. 2023
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP24-GA0-GA-R
Datum dodání záznamu
21. 5. 2024
Finance
Celkové uznané náklady
5 921 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
5 921 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč