Kooperativita nikotinických receptorů
Cíle projektu
Nikotinické acetylcholinové receptory jsou pentamerní transmembránové proteiny aktivované ze dvou nebo více kooperujících vazebných míst. Obsazení vazebných míst agonistou a otevření iontového kanálu jsou vzájemně propojeny složitou sítí stavů. Receptoryvstupují při pokračující stimulaci agonistou do uzavřeného desensitizovaného stavu.Vazebná místa pro agonisty jsou tvořena několika kličkami N-koncových částí vždy dvou sousedních podjednotek. Pomocí bodových mutací vybraných aminokyselin ve funkčně významných F a C kličkách budeme ovlivňovat aktivaci receptorů. Změny v aktivaci, desensitizaci a míře kooperativity budeme studovat kombinací biofyzikálních metod. Matematická analýza mutacemi vyvolaných změn v aktivaci, desensitizaci, inhibici a modulaciiontového kanálu bude použita k identifikaci role mutovaných aminokyselin. Charakter interakce ligandu s vazebným místem budeme blíže specifikovát pomocí termodynamické analýzy rovnovážných konstant aktivace a inhibice.
Klíčová slova
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 12 (SGA02009GA-ST)
Hlavní účastníci
—
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
202-09-0806
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Cooperativity of nicotinic receptors
Anotace anglicky
Nicotinic acetylcholine receptors are pentameric transmembrane proteins activated from two or more cooperating binding sites. Binding sites occupation by agonists is connected with ionic channel opening by complex pattern of states. In the prolonged presence of agonists, the receptor enters an inactive desensitized state. Every binding site is formed by several protein loops in the N-terminal parts of two neighboring subunits. The activation of receptors will be influenced by point mutations in selectedamino acids in loops F and C which are supposed to be functionally important. The changes in activation, desensitization and degree of cooperativity between binding sites will be studied by combination of biophysical methods. Mathematical analysis of changes in activation, desensitization, inhibition and modulation of wildtype and mutated receptors will be used to specify roles of individual mutated amino acids. Thermodynamic analysis of changes in activation and inhibition equilibrium constants will be used to specify character of ligand?receptor interaction.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
BO - Biofyzika
CEP - vedlejší obor
ED - Fyziologie
CEP - další vedlejší obor
FR - Farmakologie a lékárnická chemie
OECD FORD - odpovídající obory
(dle převodníku)10610 - Biophysics
30104 - Pharmacology and pharmacy
30105 - Physiology (including cytology)
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Projekt se zabýval studiem modulace nikotinových acetylcholinových receptorů. Byly nalezeny 3 látky (takrin, 7-MEOTA, K-577) schopné pozitivní alosterické modulace. Publikace jsou průměrné (IF 1.5 - 2.5), jediná kvalitnější v Anesteziology (IF 5.5) s pr?
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2009
Ukončení řešení
31. 12. 2012
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
1. 4. 2012
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP13-GA0-GA-U/02:3
Datum dodání záznamu
17. 5. 2016
Finance
Celkové uznané náklady
4 214 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
4 214 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Uznané náklady
4 214 tis. Kč
Statní podpora
4 214 tis. Kč
0%
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
CEP
BO - Biofyzika
Doba řešení
01. 01. 2009 - 31. 12. 2012