Chiroptické vlastnosti, konformace a dynamické chování středně velkého oligopeptidu se strukturními doménami o výrazně odlišné flexibilitě

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 1 (SGA02002GA-ST)

Hlavní účastníci

Vysoká škola chemicko-technologická v Praze

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Chiroptical properties, conformation and dynamical behaviour of the middle sized oligopeptide having structural domains with different flexibility

Anotace anglicky

Vibrational circular dichroism (VCD) spectroscopy is potentially capable to provide rather detailed information about three dimensional structure and dynamics of the difficult-to-investigate class of middle sized molecules, e.g. oligopeptides. We intendto investigate this possibility in depth using several classes of oligopeptides in the molecules of which there are either distinct domains differring in flexibility and conformation or where rigid domains are connected with flexible links. Such molecules provide a good possibility to apply ab initio techniques to interpretation of vibrational optical activity data via the technique of transferring molecular property tensors. We have selected as the main goal the so-called hinge peptide (fragment of human igG1) in which two rigid octapeptide chains rich in proline are connected via flexible disulfide links. As model systems we will also investigate dioxopiperazine molecules containing basic amino acid residues embedded in a peptide

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie

CEP - vedlejší obor

CE - Biochemie

CEP - další vedlejší obor

CC - Organická chemie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10401 - Organic chemistry<br>10403 - Physical chemistry<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Spektroskopická analýza konformace a flexibility hinge peptidu poskytla konsistentní a ucelený obraz.  Peptid si zachovává konformaci typu levotočivé šroubovice polyprolin II a k jejímu přechodu na jiný konformační typ jsou potřebné poměrně drastické zás

Zahájení řešení

1. 1. 2002

Ukončení řešení

1. 1. 2004

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP/2005/GA0/GA05GA/U/N/B:7

Datum dodání záznamu

2. 6. 2008

Celkové uznané náklady

4 126 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

1 187 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

2 939 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč