Tetrapyrrolové metalokomplexy: Modifikace triplexových struktur nukleových kyselin
Cíle projektu
Nekovalentní vazba ve vodě rozpustných metalokomplexů (porfyrinů, ftalocyaninů, naftalocyaninů, pyrazinoporfyrazinů) k jedno-, dvou- a třívláknovým nukleovým kyselinám bude studována pomocí spektroskopických metod - UV-Vis, luminiscence, transietní spektroskopie, cirkulární dichroismus. Použití techniky stopped-flow umožní popis kinetiky interakce metalokomplexů s nukleovými kyselinami, včetně sledování rychlosti dílčích reakčních kroků a faktorů ovlivňujících stabilitu vícevláknových struktur nukleových kyselin. Hlavním cílem je návrh metalokomplexů specificky interagujících s různými strukturami nukleových kyselin a katalyzujících jejich hydrolýzu. Volba centrálního iontu (lanthanidy, Mn, Fe) je podřízena nutnosti účinně hydrolyzovat DNA a RNA za fyziologických podmínek. Selektivitu zasažení specifických míst nukleových kyselin lze zvýšit konjugací metalokomplexů s oligonukleotidy rozpoznávajícími dané sekvence. Přidání oligonukleotidů tvořících triplexy (TFO) umožňuje jejich vazbu do
Klíčová slova
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 1 (SGA02002GA-ST)
Hlavní účastníci
Ústav anorganické chemie AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
—
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Tetrapyrrole Metallocomplexes for Modification of Triplex DNA Structures
Anotace anglicky
Non-covalent binding of water-soluble metallocomplexes (porphyrins, phthalocyanines, naphthalocyanines, pyrazinoporphyrazines) to single-, double- and triple-stranded nucleic acids will be studied by combination of spectroscopic methods - UV/Vis, luminescence, transient spectroscopy, circular dichroism. Application of the stopped-flow technique will afford kinetic description of metallocomplex - nucleic acid interactions including the rates of partial reaction steps and factors affecting the stability of multistranded structures of nucleic acids. The main goal is to design metallocomplexes capable of specific interaction with different nucleic acid structures and catalyzing hydrolytic cleavage. The choice of the central ion (lanthanides, Mn,Fe) is governed by the necessity to hydrolyze effectively DNA and RNA under physiological conditions. The selectivity for targeting specific sites of nucleic acids can be improved by conjugating the metallocomplexes to the sequence-recognizing
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
CA - Anorganická chemie
CEP - vedlejší obor
CE - Biochemie
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory
(dle převodníku)10402 - Inorganic and nuclear chemistry
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Nejdříve byl proveden design, syntéza a studium chování nových funkcionalizovaných porfyrinů, metaloporfyrinů, safyrinů, texafyrinů, kalix[4]fyrinů a porfyrin-oligonukleotidových konjugátů včetně kvantitativního popisu chování v roztoku vzhledem ke tvorb
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2002
Ukončení řešení
1. 1. 2004
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
—
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP/2005/GA0/GA05GA/U/N/B:7
Datum dodání záznamu
2. 6. 2008
Finance
Celkové uznané náklady
8 916 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
3 114 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
5 802 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Základní informace
Uznané náklady
8 916 tis. Kč
Statní podpora
3 114 tis. Kč
34%
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
CEP
CA - Anorganická chemie
Doba řešení
01. 01. 2002 - 01. 01. 2004