Studium vztahů mezi strukturou a funkcí fenotypově významných mutantů matrixového proteinu Mason-Pfizerova opičího viru
Cíle projektu
Tématem předkládaného projektu je analýza funkčních domén retrovirového matrixového proteinu (MA) na základě strukturních dat fenotypově významných mutantů tohoto proteinu. MA je nezbytným proteinem všech retrovirů schopných replikace a tvoří vnějšíproteinový obal zralého virionu. MA hraje klíčovou roli při tvorbě kapsidy, kde je odpovědný za transport virových proteinů do místa jejího vzniku. Bodové mutace, měnící morfogenesi retroviru ať změnou místa tvorby kapsidy nebo změnou jejího dalšíhotransportuči místa pučení, odhalily potenciální domény MA zodpovědné za tyto procesy. Kromě interních domén je nezbytná N-terminální myristylace MA, která hraje zásadní roli při tvorbě kapsid některých typů retrovirů nebo jejich transportu k buněčnémembráně. Analýza struktur tří mutantů MA se známým fenotypem (i) změna místa vzniku kapsid, ii) blok transportu kapsid k membráně iii) blok interakce kapsid s membránou) umožní nejen vysvětlit tyto změny funkce na základě strukturních dat, ale i
Klíčová slova
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 2 (SGA02003GA-ST)
Hlavní účastníci
Vysoká škola chemicko-technologická v Praze / Fakulta chemicko-inženýrská
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
—
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Study of relationships between structure and function of phenotypically relevant mutants of Mason-Pfizer monkey virus matrix protein
Anotace anglicky
The project is focused on a structural study of functional domains of phenotypically relevant mutants of retroviral matrix protein (MA), which is common to all replication competent viruses. MA protein forms the outer protein shell of a mature virion andplays a key role in the process of capsid assembly. It is responsible for the transport of viral proteins to the site of assembly. Mutations of functional domains of MA leading to changes in morphogenesis of retroviruses either by a change of the site ofassembly or a change in protein transport, were revealed. Besides those internal domains, the N-terminal myristylation of the matrix protein is required either for assembly or for transport of capsids to the plasma membrane. Structural analysis of threemutants of MA protein of the known phenotype i) changing the site of assembly, ii) preventing the transport of capsids to the plasma membrane, and iii) preventing interactions of capsids with the membrane, will make it possible to relate those functional
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
CE - Biochemie
CEP - vedlejší obor
—
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory
(dle převodníku)10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
V rámci grantového projektu se podařilo vyřešit pomocí kombinace NMR spektroskopie a výpočetních metod prostorové struktury divokého typu matrixového proteinu Mason-Pfizerova opičího viru a jeho mutantu R55F. Bylo zjištěno, že oba strukturní motivy se od
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2003
Ukončení řešení
1. 1. 2005
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
—
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP06-GA0-GA-U/07:6
Datum dodání záznamu
15. 1. 2009
Finance
Celkové uznané náklady
5 104 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
3 346 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
1 758 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Základní informace
Uznané náklady
5 104 tis. Kč
Statní podpora
3 346 tis. Kč
65%
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
CEP
CE - Biochemie
Doba řešení
01. 01. 2003 - 01. 01. 2005