Konjugáty nukleobází s komplexy kovů jako elektroaktivní značky. Využití značených oligonukleotidů v senzorech pro hybridizaci DNA

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 8 (SGA02005GA-ST)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

203/05/0043

Název projektu anglicky

Conjugates of nucleobases with metal complexes as electroactive markers. Application of labelled oligonucleotides in electrochemical DNA sensors

Anotace anglicky

The project will deal with the synthesis of novel types of conjugates of purine and pyrimidine bases with metal complexes (e.g. ferrocene, transition metal complexes of bipyridine or phenanthroline etc.) connected by a conjugated linker. Such labelled nucleosides will be transformed to protected phosphoramidites and use in oligonucleotide synthesis. We will study electrochemical behaviour of the labelled oligonucleotides in their single-stranded as well as double-stranded forms (including duplexes involving single-base mismatches). The goal is to find a system whose electrochemical features will be significantly affected by the duplex formation. Such system will be utilized in development of sensors for DNA hybridization. We suppose that effects of interactions between base pairs in the DNA double helix will be transferred through the conjugated system to the marker (metal complex). Potential markers will be also studied by theoretical chemistry calculations and the calculated ionization

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

CC - Organická chemie

CEP - vedlejší obor

CG - Elektrochemie

CEP - další vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10401 - Organic chemistry<br>10405 - Electrochemistry (dry cells, batteries, fuel cells, corrosion metals, electrolysis)<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Cíle projektu byly splněny a značně rozšířeny. Byla vypracována metodika arylací a alkynylací nukleobází a nukleosidů cross-coupling reakcemi a syntéza konjugátů nukleobází a nukleosidů s Ru a Os komplexy. Původní záměr připravovat značené oligonukleotid

Zahájení řešení

1. 1. 2005

Ukončení řešení

31. 12. 2007

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

2. 5. 2007

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP08-GA0-GA-U/04:3

Datum dodání záznamu

16. 12. 2008

Celkové uznané náklady

2 967 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

2 967 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč