Mechanizmus regulace genové exprese novým typem koaktivátoru SNW

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 1 (SGA02002GA-ST)

Hlavní účastníci

Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

The mechanism whereby the novel coactivator SNW regulates gene expression

Anotace anglicky

The transcriptional coregulator SNW coactivates CBF1, Smad3, NotchIC, and the transcription factors of the steroid hormone/vitamin D superfamily. It competes with the Ski oncoprotein for its binding site on the Smad transcription factors. The mode of itsfunction is, however, unknown. We found the coregulator to interact in S. pombe with one of the spliceosomal auxiliary factors, and in D. discoideum with a novel type of peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, which suggests the interesting possibility thatSNW targets the splicing machinery and isomerase activities to the sites of ongoing transcription. We propose to combine genetic as well as biochemical tools and fluorescence microscopy in vivo to functionally map SNW and to provide evidence for its involvement in coupling transcription to splicing. Genetic analysis of SNW will employ the complementation of the SNW knockout in S. pombe by mutants generated by site-directed approach. The down regulation of SNW will be tested for its effect on

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

V rámci projektu byly získány prioritní poznatky o proteinu Prp45/SNW/SKIP, esenciálním a evolučně konzervovaném transkripčním koregulátoru, který je implikován v regulaci buněčné proliferace během ontogenetického vývoje i rakovinného bujení. Proteiny SN

Zahájení řešení

1. 1. 2002

Ukončení řešení

1. 1. 2004

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP/2005/GA0/GA05GA/U/N/B:7

Datum dodání záznamu

2. 6. 2008

Celkové uznané náklady

4 855 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

3 055 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

1 800 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč