Rozpřažení DNA restrikční a DNA translokační funkce restrikčně-modifikačního enzymu EcoR124I - potenciálního molekulárního motoru

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 2 (SGA02003GA-ST)

Hlavní účastníci

Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Uncoupling of DNA restriction and DNA translocation functions of EcoR124I restriction-modification enzyme - a potential melecular motor

Anotace anglicky

The ability of type I restriction-modification enzyme to translocate DNA preceding restriction makes them to act as an intelligent molecular motor. We have experience with the complex enzyme EcoR124I existing in bacterial cell in equilibrium of R1M2S1andR2M2S1 complexes. Complex with only one HsdR subunit is not able to cleave DNA but retains DNA translocation ability. Therefore, there is an opportunity of studying this enzyme as a molecular motor without problems associated with DNA cleavage.However under certain circumstances even the R1-complex is able to restrict DNA. To eliminate completely this possibility we will focus on site-directed mutagenesis of three conserved amino acid residues in the endonuclease motif of HsdR subunit. We willanalyse the ability of mutant enzyme to translocate DNA across the membrane in vitro using membrane vesicles. The elongation factor Tu, a molecular switch, will be studied as a means of controlling the motor.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EE - Mikrobiologie, virologie

CEP - vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Restrikčně modifikační enzymy Typu I schopné translokovat DNA před vlastním štěpením, v procesu poháněném díky jejich vlastní ATPasové aktivitě,  představují důležitý molekulární motor. Motorová podjednotka HsdR obsahuje aminokyselinové sekvence charakte

Zahájení řešení

1. 1. 2003

Ukončení řešení

1. 1. 2005

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP06-GA0-GA-U/07:6

Datum dodání záznamu

15. 1. 2009

Celkové uznané náklady

2 153 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

2 153 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč