Endonuleazová a translokázová aktivita v restričních-modifikáčních komplexéch typu I

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 15 (SGA02012GA-ST)

Hlavní účastníci

Centrum výzkumu globální změny AV ČR, v. v. i.<br>Masarykova univerzita / Lékařská fakulta<br>Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

P207-12-2323

Název projektu anglicky

Endonuclease and translocase activity in type I restriction-modification complexes

Anotace anglicky

Type I restriction-modification enzymes differ significantly from the Type II enzymes used in cloning. Unmethylated targets induce them to pull thousands of basepairs through the enzyme before cleaving distant sites nonspecifically. We solved the first crystal structure of an intact Type I motor subunit, and proposed a mechanism for coupling its DNA translocation and cleavage activities that was affirmed by mutagenesis and crystallography. This project will apply diffraction, model-building and MD simulation, mutagenesis, and biochemical, biophysical, and in vivo analysis to acquire mechanistic data that will elucidate the structure and function of the multisubunit enzyme complex. We will also compare its features with other DNA translocases to identify general principles of protein-protein and protein-DNA interaction that underlie their function.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

CE - Biochemie

CEP - vedlejší obor

BO - Biofyzika

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10610 - Biophysics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt proběhl v souladu se schváleným návrhem, všech cílů bylo dosaženo. Na projektu se významně podíleli studenti. Spolupráce mezi řešiteli je sice vysvětlena v závěrečné zprávě, ale není doložená společnými publikacemi až na jednu výjimku. Projektu bylo dedikováno 40 publikací, avšak ve skutečnosti s ním souvisí ca 21 publikací.

Zahájení řešení

1. 1. 2012

Ukončení řešení

5. 12. 2018

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

24. 5. 2016

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP19-GA0-GA-U/05:1

Datum dodání záznamu

25. 6. 2019

Celkové uznané náklady

14 931 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

14 931 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč