CpG methylace lidských endogenních retrovirů a LINE

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 8 (SGA02005GA-ST)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

204/05/0939

Název projektu anglicky

CpG methylation of human endogenous retroviruses and LINEs

Anotace anglicky

CpG methylation of DNA is a key regulator of gene expression in vertebrates, especially in mammals and birds, and most of CpG dinucleotides out of CpG islands are methylated in position 5 of the cytosine. This applies partially to retrotransposon and retroelement copies, which are generally supposed to be genomic parasites. CpG methylation of individual retrotransposon copies, however, has not been studied so far. We therefore plan to look at CpG methylation patterns of selected human LINE copies representing both young and old families. Major attention will be given to full-length copies with potential of retrotransposition. We also plan to analyse CpG metylation in long terminal repeats of human endogenous retroviruses with special regard to W family(HERV-Ws) and its pseudogenes genrated by virtue of LINEs. The syncythin provirus, HERV-W with functional env gene on chromosome 17, is of partial importance because of its fusogenic activity during differentiation of the placental

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

EE - Mikrobiologie, virologie

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Popsali jsme epigenetické regulace lidských endogenních retrovirů kódujících fúsogenní obalové glykoproteiny (syncytiny 1 a 2) a prokázali jsme jejich účinnou inaktivaci pomocí methylace DNA ve všech tkáních mimo placentu a varlata. V testikulárních tkán

Zahájení řešení

1. 1. 2005

Ukončení řešení

31. 12. 2007

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

2. 5. 2007

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP08-GA0-GA-U/04:3

Datum dodání záznamu

16. 12. 2008

Celkové uznané náklady

3 647 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

3 647 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč