Biofyzikální analýza vybraných oblastí lidského genomu

Poskytovatel

Akademie věd České republiky

Program

Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména v AV ČR

Veřejná soutěž

—

Hlavní účastníci

Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Biophysical analysis of selected regions of the human genome

Anotace anglicky

We propose to develop software for an aligonucleotide correlation analysis in long nucleotide sequences and use it to find oligonucleotide ordering rules in the human genome. We will further write a software comparing distribution of the conformational properties of DNA along the human genome with the distribution of the oligonucleotides coding for these properties, and the genome genetic map. A further method will be developed for genome conformational analysis, taking use of sensitivity of UV light-induced damage in DNA to its conformation, and restrictase failure to cleave the damaged DNA. This method will be employed for an analysis of regions flanking dinucleotide microsatallites of the human genome. Regions exhibiting unusual conformations will be located taking advantage of their expected influence on DNA replication during PCR. These regions will finally be analyzed by spectroscopic and electrophoretic methods using oligonucleotides.

Kategorie VaV

—

CEP - hlavní obor

BO - Biofyzika

CEP - vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - další vedlejší obor

CE - Biochemie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10610 - Biophysics<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Analýza korelací vedla ke zjištění, že genomy se skládají ze dvou kvalitativně odlišných typů segmentů. Byla vyvinuta metodika pro konformační analýzu vybraných oblastí lidského genomu. Ukázalo se, že genomová DNA tvoří doménové struktury.

Zahájení řešení

1. 1. 1998

Ukončení řešení

1. 1. 2002

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP/2003/AV0/AV03IA/U/N/5:3

Datum dodání záznamu

27. 10. 2004

Celkové uznané náklady

7 736 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

2 387 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

5 281 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč