Vývoj metody pro konformační mapování lékařsky zajímavých oblastí lidského genomu
Cíle projektu
Z výsledků nosného projektu plyne, že více než polovinu oblasti lidského genomu se známou primární strukturou tvoří jednoduché, opakující se sekvenční motivy, které se od běžné DNA odlišují svou nestabilitou v kanonické dvoušroubovici a schopností nabývat alternativních konformací. Tato konformační polymorfie je asi primární příčinou prodlužování mikrosatelitů, vedoucích k řadě závažných onemocnění. V tomto projektu navrhujeme vyvinout metodu pro konformační mapování DNA podél vybraných, lékařsky zajímavých oblastí lidského genomu. Tato metoda je založena na kombinaci citlivosti poškození DNA ultrafialovým zářením k její konformaci a neschopnosti restriktáz štěpit takto poškozenou DNA. Tento záměr bude doplněn rozpracováním metody pro srážení DNA iontyzinku a jiných kovů, která svou efektivitou, jednoduchostí a materiálovou nenáročností bude mj. užitečná pro práci s rozsáhlými soubory vzorků malých množství DNA, např. v lékařské praxi.
Klíčová slova
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
—
Hlavní účastníci
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
—
Číslo smlouvy
—
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Development of a method for conformational mapping of the human genome regions of medical interest
Anotace anglicky
Development of a method for conformational mapping of the human genome regions of medical interest. Project terminated, because the applicant changed the employer.
Vědní obory
Kategorie VaV
—
CEP - hlavní obor
EB - Genetika a molekulární biologie
CEP - vedlejší obor
—
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory
(dle převodníku)10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
30101 - Human genetics
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Významným výsledkem řešení projektu je vypracování původní metody extrakce DNA zinkem. Byly určeny faktory, které mají vliv na sedimentaci DNA vyvolanou zinkem. Výsledek, který byl uveřejněn v renomovaném zahraničním časopise, nalezne obecné uplatnění v
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 1998
Ukončení řešení
1. 1. 1998
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
—
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP/1999/GA0/GA09GA/V/6:6
Datum dodání záznamu
—
Finance
Celkové uznané náklady
431 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
238 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Základní informace
Uznané náklady
431 tis. Kč
Statní podpora
238 tis. Kč
55%
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
CEP
EB - Genetika a molekulární biologie
Doba řešení
01. 01. 1998 - 01. 01. 1998