Genomový projekt bakterie Rhodobacter capsulatus

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

—

Hlavní účastníci

Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

—

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Rhodobacter capsulatus genome project

Anotace anglicky

Participation in the international programme with the goal of determining the complete nucleotide sequence of the genome of Rhodobacter capsulatus is proposed. The programme is coordinated by R. Haselkorn, the University of Chicago. R. capsulatus, is a purple bacterium with one chromosome of 3.7 Mb and a plasmid of 130 kb. The average GC content of the DNA is 70%. The bacterium has a complete photosynthetic apparatus and it fixes nitrogen. Inversions and transpositions were detected in the R. capsulatusgenome. The knowledge of the complete genetic information of the bacterium may help to explain these properties and their functional significance. The programme is ready for realization. The cosmid encyclopedia was constructed and we developed strategies and methods for large-scale sequencing of GC-rich genomes.

Kategorie VaV

—

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Stanovení převážné většiny sekvence nukleotidů fotosyntetizující bakterie Rhodobacter capsulatus a identifikace více než 2000 genů v této sekvenci představuje mimořádný objem kvalitní vědecké práce a rozšiřuje poznatky o genomech bakterií. Charakteristik

Zahájení řešení

1. 1. 1997

Ukončení řešení

1. 1. 1999

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP/2000/GA0/GA00GA/U/6:2

Datum dodání záznamu

—

Celkové uznané náklady

2 247 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

1 772 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč