Sekvenace DNA bovinního herpesviru-1 (účast v mezinárodním genomovém projektu)

Poskytovatel

Akademie věd České republiky

Program

Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména v AV ČR

Veřejná soutěž

—

Hlavní účastníci

Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

—

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Sequencing of the bovine herpesvirus-1 DNA

Anotace anglicky

Participation in the international bovine herpesvirus-1 (BHV-1) genome project is proposed. BHV-1 is a pathogen causing infectious bovine rhinotracheitis, a disease of major economic concern. The genome project is coordinated by the University of Zurich,and 15 laboratories worldwide are participating. BHV-1 DNA is 74% GC-rich, which makes its sequencing difficult. We constructed specialized vectors and worked out strategies for sequencing DNA with extreme base composition. This makes conditions favourable for our participation in the project. Selected DNA regions will be partially digested with HinPI restriction enzyme, and the resulting fragments will be cloned with M13 vectors linearized with AccI. Contigs will be assembled using the GeneSkipper software.

Kategorie VaV

—

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Byl dokončen mezinár. gen. projekt "Genom bovinního herpesviru-1". V sekvenované DNA jsme identifikovali 71 genů a regulační elementy, které řídí expresi těchto genů. Ze všech zúč. laboratoří jsme k projektu přispěli nejvíce.

Zahájení řešení

1. 1. 1997

Ukončení řešení

1. 1. 1999

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP/2000/AV0/AV00IA/U/6:3

Datum dodání záznamu

—

Celkové uznané náklady

1 272 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

849 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč