Komparativní genomika patogenních spirochet rodu Treponema: cesta k sekvenčně specifické diagnostice

Poskytovatel

Ministerstvo zdravotnictví

Program

Infekční choroby, mikrobiologie, epidemiologie a imunologie

Veřejná soutěž

Infekční choroby, mikrobiologie, epidemiologie a imunologie 2 (SMZ02003NI)

Hlavní účastníci

Masarykova univerzita / Lékařská fakulta

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Comparative genomics of pathogenic spirochetes of the genus Treponema: the route towards sequence-specific diagnostics

Anotace anglicky

The main aim of this proposal is to compare the genomes of 4 pathogenic a 1 non pathogenic treponeme. The sequence homology will be examined using DNA-microarray based methods. The heterogenic chromosomal regions will be sequenced in non-Nichols strains.Detected differences in the chromosomal sequences will be used for selective PCR diagnostics of the treponemes investigated and the diseases they cause. The recent serological tests do not allow this distinction.

Kategorie VaV

NV - Neprůmyslový výzkum (aplikovaný výzkum s výjimkou průmyslového)

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Byly porovnány genomy 3 kmenů rodu Treponema (SS14,Samoan D a Cuniculi A) pomocí DNA čipů, metody a sekvenace chromosomální DNA. Rozdíly v sekvenci genomů byly využity pro zavedení diagnostického PCR testu na syfilis.

Zahájení řešení

1. 1. 2003

Ukončení řešení

1. 1. 2005

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP06-MZ0-NI-U/01:1

Datum dodání záznamu

23. 6. 2006

Celkové uznané náklady

1 766 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

1 724 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč