Postgenomické studie syfilitické spirochety Treponema pallidum

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 6 (SGA02004GA-ST)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Postgenomic studies on Treponema pallidum, the syphilis spirochete

Anotace anglicky

The genome sequence of Treponema pallidum has been completed. Treponema pallidum subspecies pallidum is the causative agent of syphilis and is unculturable under in vitro conditions. This fact severly limits the use of standard genetic approaches to study this organism. We constructed the large insert library of T. pallidum DNA in E. coli harboring 98.7% of all T. pallidum genes on 19 individual clones. We constructed also DNA microarrays containing PCR products of all 1039 predicted T. pallidum ORFs. i) Methods of functional genomics will be used for gene function identifications. ii) Closely related T. paraluicuniculi is the etiologic agent of veneral spirochetosis of rabbits and is not infectious to humans. Genomic comparisons of both treponemes canprovide evidence of genetic diversity that can be related to the different pathogenicity of these closely related bacteria. DNA microarray-based technology allows comparisons between these organism on both DNA (genome structure) and mRNA

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

EE - Mikrobiologie, virologie

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Treponema pallidum subspecies pallidum je etiologickým agens syfilis. Genom spirochety Treponema pallidum byl studován metodami funkční genomiky, DNA microarrays a genomového sekvencování. BAC knihovna T. pallidum v E. coli, která v 19 klonech obsahuje 9

Zahájení řešení

1. 1. 2004

Ukončení řešení

1. 1. 2006

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP07-GA0-GA-U/03:2

Datum dodání záznamu

16. 10. 2007

Celkové uznané náklady

3 429 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

3 241 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

282 tis. Kč