Bariéry toku genů pro různé části myšího genomu: analýza hybridní zóny domácích myší pomocí mikrosatelitů, SINE a SNP

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 2 (SGA02003GA-ST)

Hlavní účastníci

Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Barriers to gene flow for different parts of the mouse genome: an analysis of a house mouse hybrid zone with microsatellites, SINEs, and SNPs

Anotace anglicky

The proposed project is focused on using microsatellites, SINE insertions, and SNPs in genetic mapping of the hybrid zone between house mice Mus musculus and M. domesticus. It is focused on following questions: How strong a barrier is the hybrid zone forthe gene flow between the two taxa, acting on different parts of the mouse genome? To what extent are wild populations structured? What is the individual dispersal range? For solving these problems, molecular markers will be employed mapping those partsof the genome which are supposed to play a role in impeding gene flow between the two mouse taxa (Hst1 on chromosome 17, HstX on the X, t haplotype, distal part of chrom. 19) and some autosomal markers as well. Even though the mouse genome is one of thebest studied animal genomes, studies of this extent and kind are not known: 1. Despite numbers of studies of mouse male sterility genes and t haplotype, studies of wild mice living both inside and outside the hybrid zone have not been carried out so far.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

EG - Zoologie

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10613 - Zoology<br>10614 - Behavioral sciences biology<br>10615 - Ornithology<br>10616 - Entomology<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Celkem bylo geneticky analyzováno více než 2000 myší ze 128 lokalit z 130x40 km transektu napříč myší hybridní zónou v Z Čechách a V Bavorsku. Analýzou mikrosatelitů byla stanovena míra strukturovanosti myších populací a disperze jedinců. Pomocí sady aut

Zahájení řešení

1. 1. 2003

Ukončení řešení

1. 1. 2005

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP06-GA0-GA-U/07:6

Datum dodání záznamu

15. 1. 2009

Celkové uznané náklady

5 293 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

2 616 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

2 677 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč