Bariéry toku genů pro různé části myšího genomu: analýza hybridní zóny domácích myší pomocí mikrosatelitů, SINE a SNP
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 2 (SGA02003GA-ST)
Hlavní účastníci
Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
—
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Barriers to gene flow for different parts of the mouse genome: an analysis of a house mouse hybrid zone with microsatellites, SINEs, and SNPs
Anotace anglicky
The proposed project is focused on using microsatellites, SINE insertions, and SNPs in genetic mapping of the hybrid zone between house mice Mus musculus and M. domesticus. It is focused on following questions: How strong a barrier is the hybrid zone forthe gene flow between the two taxa, acting on different parts of the mouse genome? To what extent are wild populations structured? What is the individual dispersal range? For solving these problems, molecular markers will be employed mapping those partsof the genome which are supposed to play a role in impeding gene flow between the two mouse taxa (Hst1 on chromosome 17, HstX on the X, t haplotype, distal part of chrom. 19) and some autosomal markers as well. Even though the mouse genome is one of thebest studied animal genomes, studies of this extent and kind are not known: 1. Despite numbers of studies of mouse male sterility genes and t haplotype, studies of wild mice living both inside and outside the hybrid zone have not been carried out so far.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
EB - Genetika a molekulární biologie
CEP - vedlejší obor
EG - Zoologie
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10613 - Zoology<br>10614 - Behavioral sciences biology<br>10615 - Ornithology<br>10616 - Entomology<br>30101 - Human genetics
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Celkem bylo geneticky analyzováno více než 2000 myší ze 128 lokalit z 130x40 km transektu napříč myší hybridní zónou v Z Čechách a V Bavorsku. Analýzou mikrosatelitů byla stanovena míra strukturovanosti myších populací a disperze jedinců. Pomocí sady aut
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2003
Ukončení řešení
1. 1. 2005
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
—
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP06-GA0-GA-U/07:6
Datum dodání záznamu
15. 1. 2009
Finance
Celkové uznané náklady
5 293 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
2 616 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
2 677 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč