Vodík-deuteriová výměna ve spojení s hmotnostní spektrometrií (HDX-MS) k identifikaci neznámých metabolitů detekovaných necílenou metabolomikou
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
SGA0202100005
Hlavní účastníci
Fyziologický ústav AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
21-00477S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Hydrogen-Deuterium Exchange Mass Spectrometry (HDX-MS) to Identify Unknown Metabolites Detected by Untargeted Metabolomics
Anotace anglicky
Untargeted metabolomics focuses on the analysis of all the detectable metabolites in a sample. Liquid chromatography-mass spectrometry (LC-MS)-based metabolomics can generate thousands of molecular features (retention time–m/z pairs) in biological samples per single analysis. However, only 10% of these features can be annotated and the rest of signals detected are unknowns. One of the most challenging aspects of metabolomics research is, therefore, the identification of unknown metabolites. The hypothesis will be tested that hydrogen-deuterium exchange mass spectrometry (HDX-MS) will dramatically improve the identification of unknown signals from untargeted metabolomics to derive new insights into biochemical and pathway interpretations of metabolomics data. To this end, we will optimize various LC-HDX-MS platforms for the profiling of polar metabolites and complex lipids and apply them to identify novel metabolites in mouse cecum, feces, and plasma after modification of gut microbiota with diet, antibiotics, and probiotics.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10406 - Analytical chemistry
OECD FORD - vedlejší obor
—
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
CB - Analytická chemie, separace
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 7. 2021
Ukončení řešení
31. 12. 2024
Poslední stav řešení
K - Končící víceletý projekt
Poslední uvolnění podpory
10. 3. 2023
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP24-GA0-GA-R
Datum dodání záznamu
19. 2. 2024
Finance
Celkové uznané náklady
6 428 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
6 428 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč