Nové strategie značení alkylchlorformiáty pro cílenou a srovnávací metabolomiku technikami hmotnostní spektrometrie
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 17 (SGA0201300005)
Hlavní účastníci
Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
13-18509S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
New alkyl chloroformate labeling strategies for the targeted and comparative mass spectrometry-based metabolomics
Anotace anglicky
The goal of the proposed project is to investigate new strategies of metabolite labeling with alkyl chloroformates that possess stable isotopes in their structures and to examine them in the targeted and comparative mass spectrometry-based metabolomics. The research will particularly be directed to improve bottlenecks of current metabolomics involving: (i) The metabolite identifications in complex aqueous biological matrices after a simple sample treatment with the chloroformate reagent containing and not-containing stable isotopes; (ii) The metabolite labeling in comparative (differential) metabolomics enabling direct comparison of control and targeted samples; (iii) The finding new ways of the metabolite quantitation in complex biological material. Quantitation is obtained by using of known amount of a metabolite standard, pre-labeled with a chloroformate containing stable isotopes, with its unlabeled counterpart labeled with the native reagent; (iv) The isotopomer analysis and its use in investigations of metabolic pathways and metabolites fluxes.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
CB - Analytická chemie, separace
CEP - vedlejší obor
CC - Organická chemie
CEP - další vedlejší obor
CE - Biochemie
OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
10401 - Organic chemistry<br>10406 - Analytical chemistry<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Projekt se zabývá přípravou nových chlorformiátových činidel značených stabilními isotopy deuteria a uhlíku a jejich využitím pro metabolomický výzkum. Toto značení umožnilo zkoumání reakčního mechanismu esterifikace karboxylové skupiny a jednoznačnou identifikaci reakčních produktů více než 250 protických metabolitů. Metoda je velmi dobře využitelná v biologickém a klinickém výzkumu.
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 2. 2013
Ukončení řešení
24. 11. 2016
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
1. 4. 2016
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP17-GA0-GA-U/03:1
Datum dodání záznamu
28. 6. 2017
Finance
Celkové uznané náklady
5 145 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
5 145 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč