Komplexní automatizace metabolomické analýzy biologických vzorků

Poskytovatel

Technologická agentura ČR

Program

Program na podporu aplikovaného výzkumu a experimentálního vývoje ALFA

Veřejná soutěž

ALFA 4 (STA02014TA04)

Hlavní účastníci

Biologické centrum AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

2014TA04011751

Název projektu anglicky

Complex automation of metabolomic analysis of biological samples

Anotace anglicky

The project is focused on the research and development of proprietary technology for fully automated analysis of small molecules in biological samples. The aim of the project is to develop a comprehensive tool for metabolomic analysis, which begins by inserting sample vials with a biological fluid or tissue extract in a robotic device, followed by fully automatic sample work-up and analysis. Sample preparation will be fully integrated with the standardized column separation of substances coupled with mass spectrometric detection and subsequent fully automatic processing / data extraction and assessment of the sample composition. The whole process thus will take place automatically. For successful implementation, a robotic device integrates with an autosampler capability will be designed and constructed after research and integration of all sample operations ranging from mixing, centrifugation, transfer of media, metabolites labeling with new original agents, those labeled with stable isotopes up to the evaporation, dilution and safety measures. Data measured on standard instruments will be developed and exploited by using the developed platform Metabolite Mapper, which will allow automatic data export into standard formats and processing using commercially available statistical tools. The successful achievement of project objectives will require a comprehensive approach and close cooperation between experts of basic research with experts in mechanical and automated systems, software engineering, information technology and skilled communication with experts in systems of quality control and with potential customers. The proposed project will create a new fully automated tool for efficient metabolite mapping and will contribute to the new knowledge of biological materials on a qualitatively new level. This all will contribute to the overall objectives of the ALFA Programme.

Kategorie VaV

AP - Aplikovaný výzkum

CEP - hlavní obor

FB - Endokrinologie, diabetologie, metabolismus, výživa

CEP - vedlejší obor

JD - Využití počítačů, robotika a její aplikace

CEP - další vedlejší obor

CE - Biochemie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>20204 - Robotics and automatic control<br>20205 - Automation and control systems<br>30202 - Endocrinology and metabolism (including diabetes, hormones)

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Řešení přispělo k cíli programu novými výsledky vhodnými k dalšímu testování a ověření.

Zahájení řešení

1. 7. 2014

Ukončení řešení

31. 7. 2017

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

28. 2. 2017

Důvěrnost údajů

C - Předmět řešení projektu podléhá obchodnímu tajemství (§ 504 Občanského zákoníku), ale název projektu, cíle projektu a u ukončeného nebo zastaveného projektu zhodnocení výsledku řešení projektu (údaje P03, P04, P15, P19, P29, PN8) dodané do CEP, jsou upraveny tak, aby byly zveřejnitelné.

Systémové označení dodávky dat

CEP18-TA0-TA-U/16:1

Datum dodání záznamu

6. 11. 2018

Celkové uznané náklady

9 617 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

6 248 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

3 369 tis. Kč