Segmentace a sledování buněk se složitým tvarem

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

SGA0202100005

Hlavní účastníci

Masarykova univerzita / Fakulta informatiky

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

21-20374S

Název projektu anglicky

Segmentation and tracking of cells with complex shapes

Anotace anglicky

Segmentation and tracking of living cells in microscopy images belong to bioimage informatics. Cells can have very complex non-convex shapes (e.g., having protrusions sticking out from the cell membranes) which are challenging to segment in particular in dense cell populations. In real images, many heterogeneous cell shapes can exist simultaneously and in two-dimensional images, they can even overlap. The instance segmentation problem, i.e., delineation of different objects appearing in the image is, in the state-of-the-art deep learning methods, redefined as a classification problem at pixel level. This is very limiting for handling objects with complex and possibly overlapping shapes. The objective of this project is to come with new methodologies, algorithms, and representations for better segmentation and tracking of cells with complex shapes. Our results will contribute to the ability to analyze live-cell microscopy images with higher accuracy and greater detail as well as bring novel results in the area of image segmentation, object tracking, and shape representation.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)

OECD FORD - vedlejší obor

—

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

AF - Dokumentace, knihovnictví, práce s informacemi<br>BC - Teorie a systémy řízení<br>BD - Teorie informace<br>IN - Informatika

Zahájení řešení

1. 1. 2021

Ukončení řešení

31. 12. 2023

Poslední stav řešení

—

Poslední uvolnění podpory

2. 3. 2023

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP24-GA0-GA-R

Datum dodání záznamu

21. 5. 2024

Celkové uznané náklady

6 120 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

5 100 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

1 020 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč