Segmentace a trekování živých buněk v multimodálních obrazech
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 21 (SGA0201700001)
Hlavní účastníci
Masarykova univerzita / Fakulta informatiky
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
17-05048S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Multi-modal live cell image segmentation and tracking
Anotace anglicky
Live cell segmentation and tracking problems belong to bioimage informatics and are crucially important in current cell research. A recent objective evaluation of state-of-the-art cell tracking algorithms showed that the problem is far from being solved. In particular, concentrated research is needed for dense and heterogeneous cell populations and imaging modalities that do not allow specific target labeling. We want to design and develop easy-to-use hierarchical segmentation and tracking methods suitable for different imaging modalities and their combinations that would work also for heterogeneous cell populations. We want to study the method performance based on real as well as simulated images. The methods will be tested based on benchmark data sets generally accepted by the biomedical informatics community as well as novel challenging data sets. The project will contribute to understanding how to tackle difficult segmentation and tracking problems in multi-dimensional time-lapse images.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
IN - Informatika
CEP - vedlejší obor
—
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2017
Ukončení řešení
31. 12. 2021
Poslední stav řešení
—
Poslední uvolnění podpory
3. 4. 2019
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP21-GA0-GA-R/13:1
Datum dodání záznamu
22. 2. 2021
Finance
Celkové uznané náklady
6 051 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
3 936 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
2 076 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč