NMR metodologie pro studium stereochemie bioaktivních molekul obsahujících fosfor
Cíle projektu
Naším záměrem je vyvinout NMR metodu na studium stereochemie u látek obsahujících fosfor, což je stále považováno za velkou výzvu. Ústřední myšlenka projektu spočívá ve využití 31P, jakožto magneticky aktivního isotopu fosforu poskytujícího klíčové interakce s jádry 13C a 1H. Využití 31P-13C and 31P-1H interakcí významně rozšíří aplikaci metody RDC na systémy s nízkým počtem C-H interakcí, u kterých zatím současná RDC metoda selhává. Připravíme modelové látky, vyvineme NMR experimenty s 31P jádrem (např. 31P-13C/31P-1H CLIP-HSQC) a prozkoumáme vzájemnou kompatibilitu modelových látek s médii z kapalných krystalů potřebných pro získání hodnot RDC. Získané RDC budou korelovány s teoretickými RDC, získanými z konformační analýzy cílových molekul a jejich konformerů založené na DFT výpočtech. Tato nová metoda bude dále využita pro studium medicinálně zajímavých molekul, např. léčiv obsahujících fosfor. Projekt vyústí v novou analytickou metodologii, kterou lze dále využít napříč bioorganickou a farmaceutickou chemií a biochemií.
Klíčová slova
DFT calculationsNMR spectroscopy31P NMRrelative configurationresidual dipolar couplings (RDCs)stereochemistry
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
SGA0202100005
Hlavní účastníci
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
21-23014S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
NMR Toolbox for Probing Stereochemistry in Phosphorus-Containing Bioactive Molecules
Anotace anglicky
We aim to develop a new robust NMR methodology for stereochemical studies of phosphorus-containing molecules, which is still considered to be challenging. The core idea of the project lies in using 31P as a magnetically active isotope providing the key interactions with 13C and 1H nuclei. Implementing 31P-13C and 31P-1H couplings will significantly extend the applicability of contemporary RDC method to the systems with insufficient number of C-H couplings, where it presently fails. We prepare model compounds, develop the P-based NMR experiments (such as 31P-13C/31P-1H CLIP-HSQC) and screen compatibility of the model compounds with liquid crystalline media needed for RDCs extraction. The extracted RDCs will be correlated with theoretical RDCs, obtained from conformational sampling and DFT minimizations of target molecules and their conformers. The new method will be further applied on medicinally relevant molecules, e.g. P-drugs. The project will result in novel analytical methodology, applicable generally across the fields of bioorganic and pharmaceutical chemistry, and biochemistry.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10406 - Analytical chemistry
OECD FORD - vedlejší obor
—
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory
(dle převodníku)CB - Analytická chemie, separace
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2021
Ukončení řešení
31. 12. 2023
Poslední stav řešení
—
Poslední uvolnění podpory
30. 3. 2023
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP24-GA0-GA-R
Datum dodání záznamu
21. 5. 2024
Finance
Celkové uznané náklady
5 851 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
5 688 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
18 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Základní informace
Uznané náklady
5 851 tis. Kč
Statní podpora
5 688 tis. Kč
97%
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
OECD FORD
Analytical chemistry
Doba řešení
01. 01. 2021 - 31. 12. 2023