Charakterizace nové hluboké linie eukaryot s plesiomorfními mitochondriemi
Cíle projektu
I když jsou protisté nenápadné organismy a jsou pravděpodobně méně druhově bohatí než živočichové a rostliny, představují většinu hlubokých evolučních větví eukaryot. Pojetí evoluce eukaryot a eukaryotické buňky se v poslední době dramaticky proměnilo s objevy nových protistních skupin. Jedním ze zásadních nových protist je dosud nepopsaný organismus SUM-K izolovaný v naší laboratoři. Představuje novou hlubokou evoluční linii eukaryot a vyznačuje se řadou unikátních vlastností, jako je plesiomorfní mitochondrie s versatilním energetickým metabolismem a komplexním genomem. Tento mitochondriální genom navíc obsahuje gen bakteriálního původu, který dosud nebyl v žádné mitochondrii nalezen. Kromě toho má SUM-K nový typ extruzivních organel. Cílem projektu je provést detailní analýzu organismu SUM-K s použitím kombinace přístupů, konkrétně genomiky a fylogenomiky, srovnávací transkriptomiky, ultrastrukturní analýzy včetně použití FIB-SEM a metod buněčné biologie. Výsledky by měly zásadním způsobem ovlivnit pohled na evoluci eukaryotických organismů.
Klíčová slova
protistmitochondriongenometranscriptomephylogenomic analysis
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
SGA0202100005
Hlavní účastníci
Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
21-30563S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Characterizaton of a novel deep-branching eukaryote with plesiomorphic mitochondria
Anotace anglicky
Although inconspicuous and possibly less species-rich than the metazoans or plants, the protists represent a vast majority of deep evolutionary lineages of eukaryotic organisms. The understanding of the evolution of eukaryotes and the eukaryotic cell has been dramatically informed by the discovery of novel protist lineages. The undescribed organism SUM-K, recently isolated in our laboratory, is likely such an influential protist. It represents a deep-branching eukaryotic lineage and has a high number of unique traits, including a possibly plesiomorphic mitochondrion with a versatile energetic metabolism and a complex genome with a gene of bacterial origin that has never been found in any other mitochondrion. In addition, SUM-K has a novel type of extrusive organelles. We will carry out a detailed investigation of this organism using a combination of several approaches, namely genomics and phylogenomics, comparative transcriptomics, ultrastructural analysis including FIB-SEM, and cell biology methods. The results should significantly advance our knowledge of eukaryote evolution.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10606 - Microbiology
OECD FORD - vedlejší obor
—
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory
(dle převodníku)EE - Mikrobiologie, virologie
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2021
Ukončení řešení
31. 12. 2023
Poslední stav řešení
—
Poslední uvolnění podpory
6. 3. 2023
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP24-GA0-GA-R
Datum dodání záznamu
21. 5. 2024
Finance
Celkové uznané náklady
6 315 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
6 315 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Základní informace
Uznané náklady
6 315 tis. Kč
Statní podpora
6 315 tis. Kč
100%
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
OECD FORD
Microbiology
Doba řešení
01. 01. 2021 - 31. 12. 2023