Nestandardní genetické kódy protistů a jejich evoluce
Cíle projektu
Většina organismů sdílí stejná pravidla pro čtení genetické informace pro syntézu proteinů, tj. vykazují stejný genetický kód, je ovšem známa i rostoucí řada odchylek. U eukaryot se jedná především o genetický kód v mitochondriích a v jaderných genomech některých skupin protistů. Náš tým v nedávné době objevil několik nových variant genetického kódu s neočekávanými vlastnostmi vyskytujících se v dosud málo studovaných nebo zcela neznámých protistních organismech. Předkládaný grantový návrh navazuje na tyto již publikované i nepublikované pozoruhodné výsledky a předkládá projekt bližšího zkoumání evolučního původu a distribuce některých těchto nových variant genetického kódu spolu s podrobnější charakterizací dalších aspektů biologie příslušných protistních skupin. Paralelně bude provedena bezprecedentní bioiformatická analýza dostupných sekvenčních dat systematicky hledající nové varianty genetického kódu u eukaryot. Výsledky by měly výrazně posunout naše znalosti o diverzitě eukaryot na molekulární úrovni a o obecných aspektech evoluce jednoho ze základních buněčných procesů.
Klíčová slova
diversityevolutiongenetic codegenomicsMetamonadaciliatesRhizariaprotiststranslationtRNA
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 22 (SGA0201800001)
Hlavní účastníci
Ostravská univerzita / Přírodovědecká fakulta
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
18-18699S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Non-standard genetic codes in protists and their evolution
Anotace anglicky
Most organisms share the same rules for reading the genetic information for protein synthesis, i.e. they exhibit the same genetic code, but a growing list of deviations is known. In eukaryotes these concern especially the genetic code in mitochondria and in nuclear genomes of some protist groups. Our team recently discovered several new genetic code variants with unexpected features in hitherto poorly studied or completely unknown protist organisms. This proposal builds on our already published and unpublished results and aims at closer investigation of the evolutionary origin and distribution of some of these new genetic codes, together with a more detailed characterization of other aspects of biology of the respective protist groups. In parallel, an unprecedented bioinformatics analysis of available sequence data will be performed to systematically search for new genetic code variants in eukaryotes. The results should substantially advance our knowledge of the eukaryote diversity at the molecular level and of general aspects of evolution of one of the basic cellular processes.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
OECD FORD - vedlejší obor
—
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory
(dle převodníku)EB - Genetika a molekulární biologie
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2018
Ukončení řešení
31. 12. 2022
Poslední stav řešení
—
Poslední uvolnění podpory
12. 5. 2020
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP22-GA0-GA-R
Datum dodání záznamu
22. 2. 2022
Finance
Celkové uznané náklady
7 169 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
6 101 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
1 212 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Základní informace
Uznané náklady
7 169 tis. Kč
Statní podpora
6 101 tis. Kč
85%
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
OECD FORD
Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Doba řešení
01. 01. 2018 - 31. 12. 2022