Anaerobní nálevníci jako modelová skupina pro studium alternativních jaderných genetických kódů

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

SGA0202500001

Hlavní účastníci

Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

25-17400S

Název projektu anglicky

Anaerobic ciliates as a model group to study alternative nuclear genetic codes

Anotace anglicky

For reasons that are still unclear, ciliates behave as an evolutionary hot spot for the emergence of various nuclear genetic code aberrations. All these aberrations involve reassignments of stop codons. The most frequent is the reassignment of the UAG and UAA (=UAR) codons. It originated at least 14 times independently in eukaryotes, in half of the cases in ciliates. This year, the alternative nuclear code (UAR encoding glutamine) was revealed in tropidoatractid Palmarella salina. This species belongs to APM ciliates, the group comprised of three anaerobic ciliate classes with standard code. Hence, tropidoatractids constitute an excellent model for studying evolutionary changes from standard genetic code to its most common aberration. Using transcriptomics, genomics, proteomics, tRNAseq, RiboSeq, and dual luciferase assay, we will trace how UAR codon reassignment evolved in APM ciliates. The comparative analysis with other ciliates and a diplomonad will serve us to test that UAR reassignment occurs by the exact mechanism in other ciliates and eukaryotes.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology

OECD FORD - vedlejší obor

10608 - Biochemistry and molecular biology

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

CE - Biochemie<br>EA - Morfologické obory a cytologie<br>EB - Genetika a molekulární biologie

Zahájení řešení

1. 1. 2025

Ukončení řešení

31. 12. 2027

Poslední stav řešení

Z - Začínající víceletý projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP25-GA0-GA-R

Datum dodání záznamu

24. 3. 2025

Celkové uznané náklady

11 532 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

11 532 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč