Parazitičtí prvoci Blastocrithidia a Trypanosoma jako optimální modely pro testování vzniku a vlastností alternativních genetických kódů

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

SGA0202200004

Hlavní účastníci

Biologické centrum AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

22-14356S

Název projektu anglicky

Blastocrithidia and Trypanosoma as optimal models for testing the emergence and features of alternative genetic codes

Anotace anglicky

The genetic code is not absolutely universal, since several non-standard variants have been described in the mitochondrial, as well as the prokaryotic and eukaryotic genomes. The most common deviation represents a stop-to-sense codon reassignment. We have recently described a novel protist, Blastocrithidia nonstop, in which all three stop codons specify amino acids. This drastic departure from the standard code was enabled by a previously unknown alteration of tRNA, which has also occurred in several unrelated eukaryotic lineages. Here we aim to shed light on the impact of termination factors and tRNA structure on translation in non-standard codes. Blastocrithidia and the related Trypanosoma, which has a standard genetic code, represent ideal models for dissecting the evolution of genetic code and its consequences for protein translation. Using a range of molecular and in silico approaches, we want to understand which molecular processes govern the emergence and functioning of deviated or ambiguous genetic codes.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10608 - Biochemistry and molecular biology

OECD FORD - vedlejší obor

10606 - Microbiology

OECD FORD - další vedlejší obor

30310 - Parasitology

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

CE - Biochemie<br>EB - Genetika a molekulární biologie<br>EE - Mikrobiologie, virologie<br>FP - Ostatní lékařské obory

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Jedná se o vysoce kvalitní projekt, nejen kvůli publikaci v Nature, ale i díky dalším dosaženým výsledkům. Projekt vedl k objevu nových biologických konceptů, velmi kvalitním publikacím, oceněním, pozornosti médií a dalším výstupům.

Zahájení řešení

1. 1. 2022

Ukončení řešení

30. 6. 2025

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

1. 4. 2025

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP26-GA0-GA-U

Datum dodání záznamu

13. 7. 2026

Celkové uznané náklady

10 494 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

10 205 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč