Regulace transponovatelných elementů v zárodečné dráze rostlin

Název projektu anglicky
Transposable elements regulation in plant germlines
Anotace anglicky
Although transposable elements (TEs) remain silenced in somatic tissues of plants, in germlines, the silencing is temporarily relaxed due to epigenetic genome reprogramming and TEs are active. Plants have developed defense mechanisms to prevent the harmful insertional activity of TEs in this critical stage, but little is known about the different effects of the defense mechanisms in male and female germlines on distinct TE families. Our goal is to show that most TEs proliferate either maternally or paternally and to identify epigenetic mechanisms responsible. We will study the abundance of TEs on sex chromosomes of dioecious species by FISH and annotation of their genome assemblies. We will also investigate the transcription activity of TEs and regulatory RNAs during the life cycle of model plant Silene latifolia by modern DNA and RNA sequencing techniques, robust bioinformatics methods, and experimental designs utilizing transgenic plants. We propose that parent-of-origin-specific TE proliferation is widespread in plants, but hidden in traditional hermaphroditic model species.

Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10611 - Plant sciences, botany
OECD FORD - vedlejší obor
—
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
EF - Botanika

Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP24-GA0-GA-R
Datum dodání záznamu
19. 2. 2024

Podobné projekty(10)