Vztah mezi funkčními doménami proteinu LEDGF

Název projektu anglicky
The interplay between the LEDGF chromatin reader and protein interaction modules
Anotace anglicky
LEDGF drives viral DNA integration and “mixed lineage” leukemia development. It can also replace the FACT complex role in overcoming the nucleosomal barrier to transcription. LEDGF recognizes a histone modification that marks actively transcribed chromatin and targets cellular partners to these areas. It has a modular composition, where the N-terminal chromatin reader domain is connected to the C-terminal protein interaction domain via a long intrinsically disordered region. Although it is predicted to interact with DNA in a non-specific manner, its role in LEDGF chromatin tethering is unknown. We hypothesize that the central region modulates the cooperation between chromatin recognition and protein interacting domains upon binding to nucleosomes. We will combine structural biology approaches for obtaining mechanistic insights to binding of LEDGF and its functional complexes to chromatin. Our findings will help to clarify the roles of disordered regions in structural coupling between chromatin reader and effector domains of factors regulating eukaryotic transcription.

Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - vedlejší obor
10609 - Biochemical research methods
OECD FORD - další vedlejší obor
10610 - Biophysics
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
BO - Biofyzika<br>CE - Biochemie<br>EB - Genetika a molekulární biologie

Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP25-GA0-GA-R
Datum dodání záznamu
12. 3. 2025

Podobné projekty(10)