Horizontální přenos genů v kuřecím střevním mikrobiomu: detekce a predikce antibiotického rezistomu a mobilomu
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
SGA0202200004
Hlavní účastníci
Vysoké učení technické v Brně / Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
22-16786S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Horizontal gene transfer network in chicken gut microbiome: detection and prediction of antibiotic resistome and mobilome
Anotace anglicky
Antibiotics have been widely administered as preventive treatment in first days of chicken life in commercial husbandries since newly-hatched chickens are prone to invasive pathogens, especially chicken gut is an outstanding niche for infection. Antibiotic use in farming for decades led also to the selection pressure on chicken commensal bacteria which adapted to those changes by the acquisition of antibiotic resistance genes (ARGs) via horizontal gene transfer. Extensive communication between bacteria is characteristic for gut microbiota, thus they are considered reservoirs of ARGs. The main objective of this proposal is therefore to characterize key mobile genetic elements such as ARGs and plasmids in chicken gut microbiota using the combination of genomic and cutting-edge metagenomic approaches. Next, we will determine which bacterial taxa are predominantly associated with dissemination of mobile genetic elements. Finally, we will discover novel ARGs based on systematically cloning of metagenomic DNA, followed by phenotype screening and sequencing.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
40301 - Veterinary science
OECD FORD - vedlejší obor
—
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
GJ - Choroby a škůdci zvířat, veterinární medicina
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2022
Ukončení řešení
31. 12. 2024
Poslední stav řešení
K - Končící víceletý projekt
Poslední uvolnění podpory
6. 3. 2023
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP24-GA0-GA-R
Datum dodání záznamu
19. 2. 2024
Finance
Celkové uznané náklady
9 838 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
9 838 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč