Strukturní podstata pro opětovné sestavení nukleosomu při přepisu genu zprostředkovaná proteinem Spt6

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

SGA0202200004

Hlavní účastníci

Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

22-19896S

Název projektu anglicky

Structural basis for co-transcriptional nucleosome reassembly mediated by Spt6

Anotace anglicky

Transcription elongation factor Spt6 associates with RNA polymerase II (Pol II) and acts as a histone chaperone, which promotes the reassembly of nucleosomes following the passage of Pol II. The precise mechanism of the nucleosome reassembly mediated by Spt6 remains unclear. We propose to study the nucleosome reassembly mediated by Spt6 by a combination of single particle cryo-electron microscopy (cryo-EM) and biochemical approaches. We will investigate the structural basis for the autoinhibition and activation of Spt6 that is mediated by its N-terminal region and how Spt6 interacts with histones and nucleosome. Furthermore, we will study how Spt6 cooperates with the other elongation factors Spt4/5 and Pol II to facilitate efficient nucleosome reassembly in a defined biochemical system and we will determine a cryo-EM structure of transcribing Pol II–Spt4/5–nucleosome complex with bound Spt6. Our study will decipher the role of cooperation between the intrinsically disordered and structured regions of Spt6, which regulates nucleosome and Pol II binding, and nucleosome reassembly.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10608 - Biochemistry and molecular biology

OECD FORD - vedlejší obor

—

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

CE - Biochemie<br>EB - Genetika a molekulární biologie

Zahájení řešení

1. 1. 2022

Ukončení řešení

31. 12. 2024

Poslední stav řešení

—

Poslední uvolnění podpory

29. 2. 2024

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP25-GA0-GA-R

Datum dodání záznamu

12. 3. 2025

Celkové uznané náklady

9 832 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

9 832 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč