Zásadní význam fosforylace YS. Studium interakce mezi CTD a transkripčním elongačním faktorem Spt6

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 19 (SGA0201500001)

Hlavní účastníci

Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

15-24117S

Název projektu anglicky

The importance of having YS phosphorylated. Investigation of interaction between CTD and transcription elongation factor Spt6

Anotace anglicky

Histone chaperon Spt6 is highly conserved and essential protein that functions in transcription elongation, chromatin maintenance, and RNA processing. Spt6 is required for recruitment of RNA processing factors to elongating RNA polymerase II (RNAPII). A flexible C-terminal domain (CTD) of RNPAII is recognized by tandem-SH2 motif of the Spt6 protein factor. During the transcription cycle, changes in CTD phosphorylation pattern of the conserved heptapeptide repeat Y1S2P3T4S5P6S7 control recruitment of transcription and mRNA processing factors to RNAPII. Recently, it has been shown that Y1 phosphorylation stimulates binding of the elongation factor Spt6. Here, we propose the use of nuclear magnetic resonance (NMR), dynamic transcriptome analysis (DTA), and fluorescence anisotropy (FA) assays to understand the key molecular and structural features that affect the interaction between Spt6 and specifically phosphorylated CTD in vivo and in vitro.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt úspěšně řešil detaily interakce elongačního faktoru Spt6 s CTD RNAPolII. Získaná data přinášejí nový náhled na interakci CTD a transkripčních faktorů. Bohužel, kvůli zpoždění způsobenému vyšlou konkurenční prací, nebyla stěžejní publikace dosud publikována. Na projektu jsou vykázány další tři práce, které však mají vícenásobné dedikace a týkají se interakce CTD s jiným proteinem.

Zahájení řešení

1. 1. 2015

Ukončení řešení

25. 4. 2019

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

5. 4. 2017

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP20-GA0-GA-U/01:1

Datum dodání záznamu

2. 7. 2020

Celkové uznané náklady

9 153 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

9 153 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč