Úloha komplexu TRAMP4 při tvorbě 3' konců mRNA v kvasince Saccharomyces cerevisiae

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 21 (SGA0201700001)

Hlavní účastníci

Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

17-20388S

Název projektu anglicky

The function of the TRAMP4 complex in the formation of 3'-ends of mRNAs in Saccharomyces cerevisiae

Anotace anglicky

Yeast RNA polymerase II (RNAPII) synthesizes protein-coding and non-coding RNAs (ncRNAs). There are two different mechanisms of RNAPII transcription termination, both of them regulated by the phosphorylation level of RNAPII C-terminal domain (CTD). In ncRNA termination pathway, Ser5 phosphorylated CTD serves as a mark for the interaction with CTD-interacting (CID) domain of Nrd1p, subunit of Nrd1p-Nab3p-Sen1p (NNS) termination complex. The ncRNA transcripts are subsequently polyadenylated by the Trf4p/Air1p/Air2p/Mtr4p Polyadenylating (TRAMP4) complex, which is followed by 3'-end trimming or degradation via the nuclear exosome. Ser2 phosphorylated CTD is recognized by CID of Rtt103p, which forms a complex with Rai1p and 5’-3’ exoribonuclease Rat1p to terminate the mRNA transcription process. Here, we aim to investigate the molecular principle of the newly identified interaction of Rtt103p CID and the TRAMP4 complex. Furthermore, we plan to uncover whether the Trf4p-Rtt103p interaction plays a key role in the quality control or transcription termination of protein-coding genes.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Zahájení řešení

1. 1. 2017

Ukončení řešení

31. 12. 2021

Poslední stav řešení

—

Poslední uvolnění podpory

10. 4. 2019

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP21-GA0-GA-R/11:1

Datum dodání záznamu

22. 2. 2021

Celkové uznané náklady

8 435 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

8 240 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

195 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč