Role Cdk12 a C-terminální domény RNA polymerázy II v transkripcně regulovaném procesu genomové nestability

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 18 (SGA0201400001)

Hlavní účastníci

Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

14-09979S

Název projektu anglicky

The role of Cdk12 and C-terminal domain of RNA polymerase II in transcription-coupled genome instability

Anotace anglicky

RNA polymerase II (RNAPII) directs transcription of protein-coding genes. It contains a C-terminal domain (CTD) with repeats of heptapeptide YSPTSPS where individual serines (Ser) get phosphorylated. The phosphorylation status of the CTD regulates transcription cycle and other cellular functions. Our study implicated the CTD to have a role in transcription-coupled genome instability. We identified Cyclin K-associated kinases Cdk12 and Cdk13 and found out that Cdk12 phosphorylates Ser2 in the CTD and regulates expression of DNA damage response (DDR) genes including BRCA1, FANCI and ATR. Consistently, Cdk12 is deregulated in tumors. However, the mechanism that directs expression of the Cdk12-dependent DDR genes is unknown; likewise the cellular function of Cdk13 is enigmatic. This proposal aims to: 1) identify Cdk12 and Cdk13 protein complexes, 2) investigate the role of Cdk12-dependent transcriptional elongation and mRNA processing in the expression of DDR genes and 3) clarify the role of the Ser2 kinase activity of Cdk12 in the expression of DDR genes and in the onset of cancer.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Hlavní výsledky projektu zahrnují fundamentální molekulárně genetickou charakterizaci interaktomu Cdk12/Cdk13, identifikaci cílových genů Cdk12/Cdk13 a charakterizace kinázové aktivity Cdk12 u rakoviny vaječníků. Výsledky byly publikovány v 5 článcích v oborově významných periodicích. Finanční prostředky byly čerpány v souladu s grantovými pravidly.

Zahájení řešení

1. 1. 2014

Ukončení řešení

31. 12. 2016

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

5. 4. 2016

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP17-GA0-GA-U/03:1

Datum dodání záznamu

28. 6. 2017

Celkové uznané náklady

7 155 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

7 155 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč