Nová izoforma cyklinu K je partnerem kinázy cdk12 regulující transkripci a alternativní sestřih u eukaryot

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 14 (SGA02011GA-ST)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

P305-11-1564

Název projektu anglicky

The novel isoform of cyclin K is a partner of cdk12 kinase regulating eukaryotic transcription and alternative splicing

Anotace anglicky

The transcription of protein coding genes is executed by RNA Polymerase II (RNAPII). Phosphorylation status of the C-terminal domain (CTD) of the large subunit of RNAP II is crucial for the regulation of transcription and co-transcriptional pre-mRNA processing. This ?CTD code? is orchestrated by several cyclin-dependent kinases (cdk). Cdk9 is one of these kinases; it regulates transcriptional elongation and is known to consist of one of three cyclin subunits: either cyclinT1, T2 or K (CycK). OriginallyCycK was identified as a 40 kDa protein with strong CTD kinase activity. Using immunoprecipitation with mass spectrometry we have currently found a novel, 70 kDa form of cycK that associates with cdk12. We hypothesize that this novel cycK/cdk12 complex has potent CTD kinase activity and plays an important role in the regulation of transcription and alternative splicing. In this proposal we plan to a) characterize this novel cycK/cdk12 complex; b) elucidate its CTD kinase activity; and c) learn about itsrole in the regulation of global eukaryotic transcription and alternative splicing.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt přinesl významné nové poznatky o fungování Cdk/cyklinových komplexů v živočišných buňkách (s možnou relevancí pro medicínské aplikace). Výsledky (1 původní prvoautorová práce a 2 review) byly publikovány v prestižních vysokoimpaktových časopisec?

Zahájení řešení

1. 1. 2011

Ukončení řešení

31. 12. 2013

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

12. 6. 2013

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP14-GA0-GA-U/01:1

Datum dodání záznamu

1. 7. 2014

Celkové uznané náklady

5 282 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

5 089 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

193 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč