Regulace genové exprese novým faktorem vázajícím mRNA

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 20 (SGA0201600001)

Hlavní účastníci

Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

16-10930S

Název projektu anglicky

Regulation of gene expression by a new mRNA-binding factor

Anotace anglicky

Recent studies have shown that more mRNA-binding proteins (mRBP) exist than previously thought, particularly among proteins without a canonical RNA-binding motif. Trancriptional cyclin-dependent kinases (tCDK) play a crucial role in the regulation of gene expression and onset of many human diseases. However, in the case of some tCDK, the molecular mechanisms of their function are not well-understood. Our results show that one of the tCDK binds mRNA directly in living cells via its conserved region, making it the first mRNA-binding CDK. We hypothesize that the mRNA-binding activity of the CDK plays an important and unrecognized role in the regulation of gene expression. By characterizing CDK- mRNA-binding properties, identifying its mRNA and protein partners, followed by performing functional studies, we aim to untangle the role of the CDK in the regulation of gene expression. Specifically, identifying the roles of nascent and mature mRNAs as well as of RNA polymerase II and transcriptional/co-transcriptional factors in the recruitment and function of the CDK will be our main goal.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

V souladu s cílem projektu se podařilo prokázat mechanismu funkce kinázy CDK11 v regulaci exprese histonových genů RDH na úrovni vazby na nascentní mRNA. Poznatky shrnuje jediný rukopis, který byl byl přijat k publikaci v Nature Structural & Molecular Biology (IF=12.1). Rukopis má DOI: 10.1038/s41594-020-0406-8.

Zahájení řešení

1. 1. 2016

Ukončení řešení

22. 7. 2020

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

24. 5. 2018

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP21-GA0-GA-U/01:1

Datum dodání záznamu

12. 4. 2021

Celkové uznané náklady

9 396 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

9 396 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč