Role RNA chaperonu Hfq a regulačních sRNA ve fyziologii a virulenci Bordetella pertussis
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 14 (SGA02011GA-ST)
Hlavní účastníci
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
P302-11-1940
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
The role of RNA chaperone Hfq and small RNAs in physiological fitness and virulence of Bordetella pertussis
Anotace anglicky
The stress-induced small regulatory RNAs (sRNAs) typically function by base-pairing with target mRNA and thereby affect the translational efficiency of target mRNA. Hfq, a bacterial RNA chaperon, facilitates these sRNA/mRNA interactions. The aim of this project is to elucidate the roles of Hfq and sRNAs in physiological fitness and in virulence of pathogenic Bordetella pertussis.The function of Hfq in B. pertussis will be analyzed by construction of an hfq mutant and by comparison of the hfq+/hfq- expression patterns by means of microarray and proteomics. Next, we will perform genome-wide search for sRNAs in B. pertussis using bioinformatics, RNomics, and microarray analysis. We will attempt to identify genes, which expression will be modulated by identified sRNAs in our screens, especially those involved in survival under stress conditions and in virulence. This complex approach will allow us to evaluate the impact of Hfq and identified sRNAs on physiology and pathogenicity of B. pertussis.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
EB - Genetika a molekulární biologie
CEP - vedlejší obor
EE - Mikrobiologie, virologie
CEP - další vedlejší obor
EC - Imunologie
OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30102 - Immunology
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Byly získány unikátní výsledky zaměřené na analýzu post-transkripční regulace genové exprese u lidského patogena Bordetella pertusis. Bylo prokázáno, že RNA chaperon Hfq je významným faktorem virulence B. pertusis. Byly identifikovány malé regulační RNA a u některých i jimi regulované geny. Výstupem pětiletého projektu jsou 3 publikace v kvalitních impaktovaných časopisech.
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2011
Ukončení řešení
31. 12. 2015
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
26. 3. 2015
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP16-GA0-GA-U/01:1
Datum dodání záznamu
25. 9. 2017
Finance
Celkové uznané náklady
11 940 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
11 940 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč