Identifikace a optimalizace nových úseků jaderné DNA pro fylogenetickou analýzu plicnatých plžů na druhové úrovni

Název projektu anglicky
Identifying and optimizing novel nuclear DNA regions for species-level phylogenetic signal in pulmonate snails
Anotace anglicky
This project’s aim is to employ a novel search strategy to locate additional nDNA regions for species-scale taxonomic revision in land snails, the second largest terrestrial invertebrate group. Targets will be identified by locating Ultra Conserved Elements (UCEs) which flank introns or analogous non-coding regions. We used this strategy to find, design universal primers, amplify product, obtain and align sequence from Intron 8 in the ELAV gene. This region provided the same amount of phylogentic information as previously used species-scale nDNA signals but without multiple copy variation issues in an amplicon of half the size. We will repeat this process at least an additional 24-36 times. Developing multiple nDNA species-scale targets will allow land snail taxonomists across a wide array of budget capacities the ability to empirically confront taxonomic hypotheses. Publication of this general search strategy will also allow other taxonomists the ability to locate empirical species-scale signal across all groups.

Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10613 - Zoology
OECD FORD - vedlejší obor
10619 - Biodiversity conservation
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
EG - Zoologie<br>EH - Ekologie – společenstva

Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP25-GA0-GA-R
Datum dodání záznamu
12. 3. 2025

Podobné projekty(10)