Komplexní charakterizace histonových epigenetických značek
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
SGA0202200004
Hlavní účastníci
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
22-28190S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Comprehensive characterization of histone epigenetic marks
Anotace anglicky
Histone post-translational modifications (PTMs) are essential epigenetic regulators of gene expression. As the imbalance in the modification status often leads to the disease formation, the development of methods for deeper histone characterization is of critical importance. Currently, approaches based on mass spectrometry (MS) have been applied as the first choice for PTMs analysis. The determination of histone marks is addressed mostly by shotgun proteomic analysis in combination with chemical derivatization of histone lysine residues. However, those analyses are challenging, mainly due to multiple histone variants and their modification diversity. In the project, we will develop methodology for histone characterization in both mammal and plant systems. We will particularly focus on improvement of chromatographic properties of histone peptides using novel derivatization agents, digestion using alternative proteases and use of advanced MS acquisition methods. Established protocols will be combined to a net workflow enabling paralel characterization of multiple types of histone PTMs.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10406 - Analytical chemistry
OECD FORD - vedlejší obor
—
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
CB - Analytická chemie, separace
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2022
Ukončení řešení
31. 12. 2024
Poslední stav řešení
K - Končící víceletý projekt
Poslední uvolnění podpory
10. 3. 2023
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP24-GA0-GA-R
Datum dodání záznamu
19. 2. 2024
Finance
Celkové uznané náklady
6 324 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
6 082 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
242 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč