Prostorová proteomika Euglena gracilis se zaměřením na strukturu pelikuly a import do chloroplastu
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
SGA0202300001
Hlavní účastníci
Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
23-07277S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Spatial proteomics of Euglena gracilis with a focus on its pellicle structure and chloroplast protein import
Anotace anglicky
Research on Euglena gracilis has reached several milestones: the sequencing of its transcriptome and partial genome, followed by proteomic studies on its chloroplast, mitochondrion and flagellum, have built a workable model of its cellular functions. We plan to obtain an even more precise and comprehensive proteomic map of Euglena by using LOPIT spatial proteomics, which has been very helpful in drawing proteomic atlases of the parasite Toxoplasma gondii and the flagellate Paratrimastix pyriformis. This data will be a valuable resource for future research. In downstream experiments using CRISPR-Cas9 in situ tagging and RNAi knockdowns, we aim to validate protein factors predicted by our LOPIT data to function in Euglena’s endomembrane pathway putatively to move proteins to the chloroplast and transport them across its envelope. The spatial proteomic data will also allow us to scrutinise the pellicle: the elaborate structure supporting Euglena’s cell surface, which is responsible for its characteristic and unusual form of movement by a still-unclear mechanism.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10601 - Cell biology
OECD FORD - vedlejší obor
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - další vedlejší obor
10606 - Microbiology
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
CE - Biochemie<br>EA - Morfologické obory a cytologie<br>EB - Genetika a molekulární biologie<br>EE - Mikrobiologie, virologie
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2023
Ukončení řešení
31. 12. 2025
Poslední stav řešení
K - Končící víceletý projekt
Poslední uvolnění podpory
29. 2. 2024
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP25-GA0-GA-R
Datum dodání záznamu
21. 2. 2025
Finance
Celkové uznané náklady
10 422 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
10 422 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč