Vývoj metodologie pro výzkum proteomu pomocí hmotnostní spektrometrie

Poskytovatel

Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy

Program

Finanční mechanismy EHP/Norsko

Veřejná soutěž

Finanční mechanismy EHP/Norsko 2 (SMSM20167F001)

Hlavní účastníci

Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

MSMT-35776/2016-1

Název projektu anglicky

Methodology development in mass spectrometry- based proteomics

Anotace anglicky

Top-down proteomics is a method of protein identification that uses a mass spectrometer (MS) to analyse intact proteins. The ability to decipher the accurate mass of an intact protein provides invaluable information including identification of protein species arising from amino acid modifications, gene variants, transcript variation, signal peptide cleavages, and posttranslational modifications (PTMs). Top-down proteomics is a relatively young field compared to bottom-up proteomics and has been significantly developed during the last years. However, top-down proteomics still suffers from limitations concerning detection by mass spectrometry, bioinformatic data analysis, quantification and protein separation. In this project, we will address protein separation by capillary electrophoresis hyphenated to mass spectrometer by recently developed interface. This activity will enable conditions for efficient communication between Czech and Norwegian research teams. It is aimed to define current needs and challenges in proteomic research and subsequently evaluate experimentally newly developed technology for analysis of complex tasks by MS. Participation of Czech Ph.D. students in form of study trips at partner laboratory will contribute to their professional development and enable to share know-how in the field of proteomics. This can be viewed as important outcome of this initiative. Finally, based on achieved data, perspectives for further collaboration of both teams will be drawn.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

CC - Organická chemie

CEP - vedlejší obor

CE - Biochemie

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10401 - Organic chemistry<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle projektu a jeho předpokládané výsledky v rozhodnutí.

Zahájení řešení

14. 11. 2016

Ukončení řešení

30. 4. 2017

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

30. 1. 2017

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP18-MSM-7F-U/05:1

Datum dodání záznamu

21. 11. 2018

Celkové uznané náklady

242 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

242 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč