Pangenomický pohled na expandující centromeru
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
SGA0202400001
Hlavní účastníci
Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
24-10036S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
A pangenomic view of expanding centromere
Anotace anglicky
Centromeres are essential chromosomal regions that facilitate proper segregation of genetic material during cell division. Despite their conserved function, centromeres exhibit high variation in size, structure, and sequence composition. However, the molecular and evolutionary processes underlying this variation are poorly understood, compromising our understanding of the general principles of centromere biology. To address this knowledge gap, we propose to elucidate the mechanisms of centromere evolution by investigating complete sequence assemblies of centromere regions that have become available thanks to recent advances in sequencing and genome assembly technologies. Our approach will be pangenomic, meaning that we will examine sequence and epigenetic variation among centromeres of multiple genotypes within the same species and among closely related taxa. The proposed research will focus on the legume tribe Fabeae, which exhibits rapid evolutionary dynamics of its centromeres, as evidenced by the enlargement of these regions to form metapolycentric chromosomes.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
OECD FORD - vedlejší obor
—
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
EB - Genetika a molekulární biologie
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2024
Ukončení řešení
31. 12. 2026
Poslední stav řešení
Z - Začínající víceletý projekt
Poslední uvolnění podpory
—
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP24-GA0-GA-R
Datum dodání záznamu
22. 2. 2024
Finance
Celkové uznané náklady
10 483 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
10 483 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč