Přeprogramování osudu krvetvorných buněk u kaprovitých ryb

Název projektu anglicky
Reprogramming the fate of hematopoietic cells in cyprinid fish
Anotace anglicky
Blood development is a multistep process of formation and turnover of blood cells and it is precisely regulated by a variety of extrinsic and intrinsic factors. Historically, reprogramming of cells from one lineage to the other, was achieved by ectopic expression of single or multiple transcription factors. Here we have employed the zebrafish model and recently established EPO-dependent cell line (ZEB) and show that the committed erythroid cells can be reprogrammed into myeloid cells by G-CSF only. To understand the mechanisms underlying the reprogramming of ZEB cells, we will perform extensive transcriptome profiling followed by the analysis of the epigenetic landscape during the reprograming process. To achieve that, we will employ ATAC-seq, ChIP-seq or CUT&Tag to reveal activated and repressed loci and their respective regulatory sequences. Correlating gene expression and chromatin accessibility together with transcription factor binding site enrichment analysis will lead to identification of potential master regulatory transcription factors responsible for reprograming.

Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10601 - Cell biology
OECD FORD - vedlejší obor
—
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
EA - Morfologické obory a cytologie

Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP24-GA0-GA-R
Datum dodání záznamu
22. 2. 2024

Podobné projekty(10)