Mapování dostupnosti povrchových oblastí solubilních a membránových proteinů pomocí reaktivních sond

Název projektu anglicky
Mapping Accessible Surface Area of Soluble and Membrane Proteins by Employing Reactive Probes
Anotace anglicky
Structural proteomics is an emerging direction in structural biology. It covers very broad range of analytical methods from hydrogen/deuterium exchange (HDX) over covalent labeling to chemical cross-linking. In contrast to the HDX, covalent labeling targets amino acid side chains in the protein sequence so it provides complementary structural information. The original labeling approach relies on modification of selected amino acids whereas the fast photochemical oxidation of proteins (FPOP) targets almost any side chains. Recently, a fluoroalkyl radical footprinting has been successfully adopted. It allows haracterization of the solvent-accessible surface area of the proteins by targeting aromatic amino acids. Another footprinting technique that is currently tested for structural studies is based on oxidation by singlet oxygen. Because both fluoralkyl radical and singlet oxygen are relatively non-polar chemical probes, it is worth investigating their potential to label soluble and membrane proteins and thus studying their structural rearrangement in combination with FPOP.

Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10406 - Analytical chemistry
OECD FORD - vedlejší obor
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - další vedlejší obor
10609 - Biochemical research methods
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
CB - Analytická chemie, separace<br>CE - Biochemie<br>EB - Genetika a molekulární biologie

Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP25-GA0-GA-R
Datum dodání záznamu
5. 3. 2025

Podobné projekty(10)