Počítačová analýza prodlužování mikrosatelitů v lidském genomu

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

—

Hlavní účastníci

Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

—

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Computer analysis of microsatellite expansion in the human genome.

Anotace anglicky

Eucaryotic genomes contain hundreds of thousands of microsatellite sequences whose expansion above a critical lenght,cause serious diseases in some cases.In this project,we will analyze the EMBL nucleotide sequences by computer methods to find answers tothe following questions:(i)Do all microsatellites expand or are there non-expanding microsatellites in the eucaryotic genomes?(ii)Does the answer to the previous question depend on the type of organism?(iii) If microsatellites exist that do not expand, which of their other properties distinguish them from the expanding microsatellites?(iv) Are microsatellites located at specific genomic positions?(v) How are microsatellites connected to the bulk genomic DNA and what characterizes the transition regions?Answers to these questions may contribute to an understanding of the reasons and mechanisms of the microsatellite expansion and, maybe, of the circumstances leading to their pathological variants.

Kategorie VaV

—

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Závěrečná zpráva je napsána dostatečně obsáhlou formou, je pečlivá a má všechny náležitosti. U přiložených publikací nechybí údaj o podpoře GA ČR. Badatelský záměr splnil všechny předepsané cíle. Na základě tří doložených publikací jsou výstupy řešení ho

Zahájení řešení

1. 1. 1997

Ukončení řešení

1. 1. 1998

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP/1999/GA0/GA09GA/V/6:6

Datum dodání záznamu

—

Celkové uznané náklady

1 046 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

821 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč