Bioinformatická předpověď intergenových struktur u aktinomycet
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 12 (SGA02009GA-ST)
Hlavní účastníci
—
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
303/09/0475
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Biocomputational prediction of intergenic structures in Actinomyces
Anotace anglicky
The proposed project is aimed at the biocomputational prediction and identification of functional intergenic structures as transcription terminators, small RNAs, riboswitches and antisense RNAs in the intergenic regions in Actinomyces genomes. The Actinomycetes is a very divers bacterial class, including pathogens, differentiating bacteria, producers of antibiotics and amino acids, with large genomes. Therefore, a large number of functional intergenic structures is expected in Actinomyces, forming a complex and unique regulatory apparatus. The structures will be predicted in Actinomyces intergenic regions based on sequence conservation and genomic features, specific for the functional structures. Identification of the predicted structures will be basedon sequence and structure similarity to known intergenic structures of other bacterial species in public databases. Besides the new Actinomyces structures themselves, a new database of the structures will be established.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
CE - Biochemie
CEP - vedlejší obor
—
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Řešení projektu proběhlo podle plánu jak z hlediska odborného tak i z hlediska čerpání finančních prostředků.
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2009
Ukončení řešení
31. 12. 2011
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
16. 4. 2011
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP12-GA0-GA-U/02:2
Datum dodání záznamu
2. 5. 2016
Finance
Celkové uznané náklady
2 112 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
2 112 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč