Úloha RNA vazebných proteinů podílejících se na úpravách mitochondriálních transkriptů u Trypanosoma brucei

Poskytovatel

Akademie věd České republiky

Program

Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména v AV ČR

Veřejná soutěž

Výzkumné granty 7 (SAV02007-A)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

IAA500960705

Název projektu anglicky

The role of Trypanosoma brucei RNA binding proteins in mitochondrial transcript processing.

Anotace anglicky

The RNA metabolism of trypanosomatids has many unusual aspects, e.g U-insertion/deletion RNA editing. Much research has focused on the core RNA editing machinery, while other accessory factors, proteins implicated in this process, are in various stages of understanding. We have recently shown, also by solving its crystal structure, that the MRP protein complex has a multifarious role in RNA metabolism. Preliminary data suggest a role in RNA editing and perhaps in other RNA processing for TbRGG1 and REAP1. We propose to further the understanding of these genes via the functional genetic tools available in Trypanosoma brucei to i/ silence specific genes to determine an effect on RNA editing or other RNA processing events; ii/ knock-in tagged wild-type ormutant versions of these genes to find protein partners and determine features that facilitate this binding; iii/ over-express the above and newly discovered proteins for in vitro RNA binding assays and structural studies.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Identifikovali jsme zcela nový komplex asi 10ti proteinů, označovaný MRB1. Některé jeho podjednotky se účastní procesování guide RNA, jiné ovlivňují stabilitu mRNA. Ukázali jsme, že T. evansi a T. equiperdum jsou petite mutanti Trypanosoma brucei.

Zahájení řešení

1. 1. 2007

Ukončení řešení

31. 12. 2010

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

9. 3. 2010

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP11-AV0-IA-U/02:2

Datum dodání záznamu

28. 6. 2013

Celkové uznané náklady

4 911 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

4 911 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč