Funkční analýza vybraných proteinů účastnících se editování RNA u bičíkovce Trypanosoma brucei

Poskytovatel

Akademie věd České republiky

Program

Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména v AV ČR

Veřejná soutěž

Výzkumné granty 3 (SAV02003-A)

Hlavní účastníci

Parazitologický ústav AV ČR

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Functional analysis of candidate components of the RNA editing machinery in the flagellate Trypanosoma brucei

Anotace anglicky

Trypanosoma brucei is thecausative agent of serious diseases of man and animals. In the mitochondrion of this primitive flagellate, mRNAs undergo extensive editing. Several proteins that participate in this process do not have homologs in higher eukaryotes, and thus represent promising pharmacological targets. We want to prepare, using RNA interference, inducible knock-out cells lines for guide RNA binding proteins 21 and 25, RNA helicase, and RNA ligase. After one (or more) of the above-mentioned mRNAsand proteins will be (partially) eliminated due to the in vivo transcription of specific double stranded RNA, resulting phenotype will be analyzed by a wide range of methods. This functional analysis shall significantly improve our understanding of thecomplex mechanism of RNA editing.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

EG - Zoologie

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10613 - Zoology<br>10614 - Behavioral sciences biology<br>10615 - Ornithology<br>10616 - Entomology<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Určili jsme funkci proteinů MRP1 a MRP2, nezbytných při editování mtRNA a vážících se na gRNA u Trypanosoma brucei. Dále jsme provedli funkční analýzu jaderně kódovaných podjednotek respiračních komplexů a proteinů účastnících se tvorby FeS komplexů.

Zahájení řešení

1. 1. 2003

Ukončení řešení

1. 1. 2005

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP06-AV0-IA-U/04:2

Datum dodání záznamu

26. 9. 2007

Celkové uznané náklady

2 248 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

1 838 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč