Studium vztahu mezi strukturou proteinu gBP21 a gRNA a jejich funkcí při editování RNA u Trypanosoma brucei

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Postdoktorandské granty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 7 (SGA02004GA1PD)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Structure and function of the Trypanosoma brucei guide RNA binding protein 21 and its complex with the guide RNA molecule

Anotace anglicky

Trypanosoma brucei is the etiological agent of lethal African sleeping sickness. It annually affects millions of people and their domestic animals and no suitable treatment protocol is available. T. brucei is characterized by plethora of unique featuresincluding a uridine deletion/insertion type of RNA editing. This process, which is essential for the pathogen, does not exist in the metazoan host. Targeting of individual steps of the RNA editing process has, therefore, a potential to be an efficient way of treatment of the sleeping sickness. This proposal is aiming to study mechanism of recognition and binding of the guide RNA (gRNA) molecules to guide-RNA binding protein 21 (gBP21). gBP proteins stimulate annealing of pre-mRNA to gRNA, which servesastemplate for site-specific insertions and deletions of the uridine nucleotides into otherwise non-translatable mRNA molecules. From this point of view, gRNA-gBP21 interaction represents fundamental process for proper RNA editing. We will use

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

CE - Biochemie

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Cílem předloženého projektu je strukturní charakterizace proteinového komplexu MRP1/MPR2 z Trypanosoma brucei a určení jeho role v procesu editování RNA. Za nativních podmínek jsme izolovali MRP1 z T. Brucei. Následná analýza ukázala, že MRP1 za podmínek

Zahájení řešení

1. 1. 2004

Ukončení řešení

1. 1. 2006

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP07-GA0-GP-U/03:2

Datum dodání záznamu

16. 10. 2007

Celkové uznané náklady

984 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

984 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč